MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid1

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017471	ATT	2	6	1284	1289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818455
2	NC_017471	CAAT	2	8	1314	1321	50 %	25 %	0 %	25 %	385818455
3	NC_017471	CTA	2	6	1323	1328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818455
4	NC_017471	AAT	2	6	1339	1344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818455
5	NC_017471	ATTCC	2	10	1359	1368	20 %	40 %	0 %	40 %	385818455
6	NC_017471	CCA	2	6	1373	1378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818455
7	NC_017471	TGC	2	6	1398	1403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818455
8	NC_017471	TAA	2	6	1404	1409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818455
9	NC_017471	ATT	2	6	1565	1570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818455
10	NC_017471	TTC	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818455
11	NC_017471	A	6	6	1740	1745	100 %	0 %	0 %	0 %	385818455
12	NC_017471	GAA	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818455
13	NC_017471	CATT	2	8	1797	1804	25 %	50 %	0 %	25 %	385818455
14	NC_017471	A	7	7	1808	1814	100 %	0 %	0 %	0 %	385818455
15	NC_017471	AACT	2	8	1899	1906	50 %	25 %	0 %	25 %	385818455
16	NC_017471	ACA	2	6	1985	1990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818455
17	NC_017471	TTC	2	6	2006	2011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818455
18	NC_017471	AAAT	2	8	2034	2041	75 %	25 %	0 %	0 %	385818455
19	NC_017471	CCA	2	6	2046	2051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818455
20	NC_017471	ACTA	2	8	2056	2063	50 %	25 %	0 %	25 %	385818455
21	NC_017471	TGA	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818456
22	NC_017471	ATC	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818456
23	NC_017471	AAC	2	6	2912	2917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818457
24	NC_017471	AACG	2	8	3005	3012	50 %	0 %	25 %	25 %	385818457
25	NC_017471	TAAA	2	8	3077	3084	75 %	25 %	0 %	0 %	385818457
26	NC_017471	ACT	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818458
27	NC_017471	GTA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818458
28	NC_017471	GCA	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818458
29	NC_017471	A	7	7	3559	3565	100 %	0 %	0 %	0 %	385818458
30	NC_017471	GTAATT	2	12	3624	3635	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385818459
31	NC_017471	AAT	2	6	3705	3710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818459
32	NC_017471	CAT	2	6	3750	3755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818459
33	NC_017471	TGC	2	6	3796	3801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818459
34	NC_017471	ATA	2	6	3805	3810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818459
35	NC_017471	T	6	6	3814	3819	0 %	100 %	0 %	0 %	385818459
36	NC_017471	ATC	2	6	3853	3858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818459
37	NC_017471	ATT	2	6	3883	3888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818459

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.